Первым руководителем ЦБС была Денисова Валентина Мухамедзяновна (1994 – 2005).

31 декабря 2009 года создано муниципальное учреждение «Межпоселенческая библиотека Нефтеюганского района». В соответствии с соглашениями между органами местного самоуправления муниципальных образований Учреждение является организационно-методическим, консультативным, библиотечно-техническим, информационно-библиографическим центром для библиотек городского и сельских поселений муниципального образования Нефтеюганский район (12 сельских библиотек смешанного типа, взрослая и детская библиотеки городского поселения Пойковский).

В соответствии с требованиями Федерального закона № 83-ФЗ от 08.05.2010 года Муниципальное учреждение «Межпоселенческая библиотека Нефтеюганского района» 19.04.2011 г. переведено в Бюджетное учреждение Нефтеюганского района «Межпоселенческая библиотека».

С 2008 года директор, заслуженный деятель культуры Нефтеюганского района (2014) – Занкина Татьяна Владимировна.

Централизованная районная библиотека // Нефтеюганская
централизованная библиотечная система. 10 лет вместе: буклет / Администрация Нефтеюганского района; комитет по культуре; составители: Н. В. Бутько, В. М. Денисова, Н. В. Лысенко; ответственная за выпуск: В. М. Денисова. – Пыть-Ях: Сибполиграф, 2004. – 17 с.
2014 год – юбилейный // Югорское обозрение. - 2014. - 16 октября - С. 15.